More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0893 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 657 aa  1314    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  60.06 
 
 		 604 aa  706    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  71.43 
 
 		 674 aa  891    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  70.2 
 
 		 687 aa  874    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  65.69 
 
 		 664 aa  839    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  68.28 
 
 		 660 aa  882    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  78.38 
 
 		 635 aa  956    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  60.59 
 
 		 651 aa  738    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  69.49 
 
 		 622 aa  853    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  69.86 
 
 		 644 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  74.75 
 
 		 698 aa  944    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  98.93 
 
 		 657 aa  1300    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  54.35 
 
 		 636 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  53.52 
 
 		 647 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  50.14 
 
 		 681 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  53.19 
 
 		 635 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  50.14 
 
 		 681 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  51.72 
 
 		 661 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  51.72 
 
 		 661 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  51.65 
 
 		 652 aa  611  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  52.44 
 
 		 705 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  51.87 
 
 		 661 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  50.3 
 
 		 667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  50.3 
 
 		 667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  49.13 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  50.67 
 
 		 655 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  50.07 
 
 		 667 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  50.07 
 
 		 662 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.69 
 
 		 615 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  46.71 
 
 		 616 aa  548  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  47.26 
 
 		 625 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  47.33 
 
 		 613 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  44.53 
 
 		 630 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.23 
 
 		 623 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.22 
 
 		 629 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  47.07 
 
 		 621 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  46.84 
 
 		 628 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  47.38 
 
 		 598 aa  515  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.9 
 
 		 619 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  45.2 
 
 		 641 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  43.55 
 
 		 641 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  45.3 
 
 		 633 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  47.1 
 
 		 636 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  45.17 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  45.17 
 
 		 633 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.85 
 
 		 633 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  45.34 
 
 		 632 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  44.87 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  45.59 
 
 		 644 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  44.6 
 
 		 648 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  46.33 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 		 633 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  44.24 
 
 		 645 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  44.46 
 
 		 611 aa  492  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  41.26 
 
 		 630 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.31 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  44.22 
 
 		 620 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.5 
 
 		 617 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  43.1 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  40.55 
 
 		 632 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  41.72 
 
 		 643 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  41.17 
 
 		 626 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  43.28 
 
 		 643 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  41.73 
 
 		 620 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  41.33 
 
 		 597 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  41.17 
 
 		 595 aa  412  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  41.17 
 
 		 595 aa  412  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  41.49 
 
 		 632 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  42.73 
 
 		 612 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  41.83 
 
 		 616 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 		 595 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  40.8 
 
 		 603 aa  405  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  40.19 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  41.15 
 
 		 594 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  39.82 
 
 		 623 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  41.06 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  39.88 
 
 		 599 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  40.63 
 
 		 644 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  39.82 
 
 		 623 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 618 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  36.95 
 
 		 574 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  36.95 
 
 		 575 aa  399  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  40.31 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  57.99 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  40.71 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  39.75 
 
 		 600 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  58.08 
 
 		 687 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.43 
 
 		 602 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  42.07 
 
 		 687 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  36.9 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  41.43 
 
 		 661 aa  389  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>