More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3974 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.53 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  43.53 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.76 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  35.22 
 
 		 157 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.12 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00540082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  32.93 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.29 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  32.32 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.12 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.23 
 
 		 334 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.45 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.53 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.27 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.13 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.22 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.17 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  29.87 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  26.58 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  28.83 
 
 		 184 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  28.22 
 
 		 184 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  28.34 
 
 		 189 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.56 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  28.05 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  32.05 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  28.22 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  27.61 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.88 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.39 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  26.99 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  28.22 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.68 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  28.57 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  29.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  31.61 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.99 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  26.28 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.54 
 
 		 165 aa  62  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  27.44 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  28.22 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  28.22 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.99 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.67 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  29.68 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.8 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  26.54 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.4 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.4 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.74 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  28.48 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.39 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  43.84 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.66 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  28.48 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.48 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  26.54 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.93 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  25.31 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1582  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.41 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00138876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  25.15 
 
 		 166 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  58.14 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.06 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  32.28 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.83 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  25.93 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  52 
 
 		 546 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.78 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 		 167 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48 
 
 		 447 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.56 
 
 		 579 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54 
 
 		 435 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  26.54 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  43.28 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  26.54 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  26.54 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0794  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48 
 
 		 440 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.54 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  24.69 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.37 
 
 		 476 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  25.31 
 
 		 171 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  25.31 
 
 		 171 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  42.19 
 
 		 514 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  29.84 
 
 		 194 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 		 544 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  58.14 
 
 		 427 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  24.24 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.59 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.92 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  45.33 
 
 		 474 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  25.45 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.73 
 
 		 473 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000116248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44 
 
 		 473 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000747673  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 		 679 aa  50.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>