207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  100 
 
 
168 aa  344  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  72.02 
 
 
166 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  71.43 
 
 
166 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  69.64 
 
 
167 aa  249  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  61.5 
 
 
187 aa  246  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  61.5 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  60.87 
 
 
184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  60.33 
 
 
184 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  60.33 
 
 
184 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  60.33 
 
 
184 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  64.33 
 
 
171 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.39 
 
 
337 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.41 
 
 
331 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.92 
 
 
331 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.91 
 
 
334 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.2 
 
 
341 aa  147  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  42.86 
 
 
166 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  49.64 
 
 
185 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  42.07 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.48 
 
 
194 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  42.44 
 
 
171 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  42.77 
 
 
171 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.23 
 
 
165 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  46.85 
 
 
171 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  46.85 
 
 
186 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.31 
 
 
174 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  46.04 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.04 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  46.04 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.2 
 
 
175 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  51.75 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  45.65 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  42.68 
 
 
309 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  40.61 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.24 
 
 
171 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.17 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.03 
 
 
179 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  42.46 
 
 
179 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  42.77 
 
 
180 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.28 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  42.5 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.45 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  36.21 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.45 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.13 
 
 
167 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.94 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  41.06 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  43.48 
 
 
157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.26 
 
 
160 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  40.96 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.58 
 
 
171 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  42.33 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  43.8 
 
 
160 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  44.29 
 
 
171 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.26 
 
 
166 aa  120  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  40.57 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  40.57 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.83 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  42.75 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  39.86 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.88 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  41.36 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  41.43 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.13 
 
 
209 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.57 
 
 
169 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.99 
 
 
182 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  32.5 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  31.45 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.95 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  30.95 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.14 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  34.78 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.45 
 
 
252 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.83 
 
 
241 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.64 
 
 
247 aa  67.4  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  27.01 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.4 
 
 
449 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.58 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  30.87 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.03 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.72 
 
 
388 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.63 
 
 
249 aa  61.6  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  32.48 
 
 
545 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  28.7 
 
 
238 aa  61.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  28.9 
 
 
246 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  47.06 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  30.83 
 
 
256 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  29.59 
 
 
246 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  30.89 
 
 
481 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 
247 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>