190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3771 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
174 aa  359  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  53.24 
 
 
171 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.25 
 
 
341 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.83 
 
 
337 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.43 
 
 
331 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.71 
 
 
331 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  60.87 
 
 
309 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.28 
 
 
334 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  43.6 
 
 
187 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.41 
 
 
175 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  44.79 
 
 
180 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  49.66 
 
 
182 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  44.38 
 
 
166 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  51.41 
 
 
188 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  46.86 
 
 
178 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
182 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.67 
 
 
192 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  44.79 
 
 
167 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  52.48 
 
 
186 aa  141  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  40.74 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.65 
 
 
179 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  40.24 
 
 
188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  46.05 
 
 
185 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  39.51 
 
 
166 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  43.15 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.76 
 
 
187 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  41.98 
 
 
171 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  41.36 
 
 
186 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  43.79 
 
 
153 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  41.21 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.93 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  41.36 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.4 
 
 
188 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  41.4 
 
 
188 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  41.4 
 
 
188 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.75 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  44.31 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.79 
 
 
165 aa  134  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  44.76 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  48.57 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.48 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  47.86 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.97 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.65 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.75 
 
 
179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  46.1 
 
 
146 aa  131  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  47.83 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  44.53 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.17 
 
 
171 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.88 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.74 
 
 
171 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.18 
 
 
167 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  40.4 
 
 
158 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  38.61 
 
 
160 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  44.6 
 
 
184 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  44.6 
 
 
184 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  43.33 
 
 
184 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.83 
 
 
164 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.29 
 
 
169 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  43.33 
 
 
184 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.52 
 
 
167 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.22 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.67 
 
 
166 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  43.66 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  43.66 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  38.75 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.58 
 
 
241 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  35.85 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  28.33 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  30.49 
 
 
281 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.49 
 
 
281 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  38.06 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.28 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  33.9 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.24 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.06 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.49 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.72 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  38.61 
 
 
545 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  49.21 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.96 
 
 
449 aa  67.8  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.19 
 
 
252 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  33.33 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  31.62 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  36.44 
 
 
502 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  30.12 
 
 
357 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  30.49 
 
 
355 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  46.75 
 
 
122 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  31.21 
 
 
504 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  35.59 
 
 
494 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  30.41 
 
 
462 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  35.59 
 
 
485 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  30.41 
 
 
462 aa  62  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>