123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3666 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
171 aa  333  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  98.25 
 
 
171 aa  325  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  83.04 
 
 
171 aa  266  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  50.3 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  53.62 
 
 
175 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.9 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2057  hypothetical protein  43.31 
 
 
162 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2067  hypothetical protein  42.52 
 
 
162 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.16 
 
 
337 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.79 
 
 
331 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.25 
 
 
642 aa  70.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.77 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  26.17 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  28.91 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  34.38 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  33.08 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.28 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.91 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  28.21 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.83 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  31.69 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.82 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  31.85 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  28.7 
 
 
309 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  31.43 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  28.07 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  29.63 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  31.09 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.95 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.22 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.47 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.61 
 
 
375 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.87 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  30.87 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  30.87 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  30.87 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  30.71 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  29.21 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  28.65 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  31.43 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  31.43 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  29.8 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  31.25 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.14 
 
 
194 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.45 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  29.8 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  31.5 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.47 
 
 
181 aa  58.2  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.93 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  28.26 
 
 
177 aa  57.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  27.41 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  24.82 
 
 
166 aa  57.8  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.59 
 
 
413 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  30.71 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.5 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  28.8 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  31.75 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  31.75 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  30.66 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.29 
 
 
431 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.75 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.03 
 
 
166 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  30.77 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
304 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.59 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.25 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.56 
 
 
499 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.6 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 
374 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.55 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.99 
 
 
414 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.43 
 
 
404 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.86 
 
 
281 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  30.86 
 
 
281 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  24.19 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.15 
 
 
192 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.03 
 
 
195 aa  50.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  28.7 
 
 
171 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  30.71 
 
 
186 aa  50.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.41 
 
 
437 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.81 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.11 
 
 
217 aa  47.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.49 
 
 
409 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.07 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  30.09 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.91 
 
 
415 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  31.11 
 
 
439 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  26.6 
 
 
256 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.69 
 
 
213 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  31.75 
 
 
323 aa  44.3  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  31.11 
 
 
412 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  30 
 
 
403 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>