172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7151 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
179 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  86.59 
 
 
179 aa  329  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  64.38 
 
 
188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  66.06 
 
 
186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  50.86 
 
 
182 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.67 
 
 
331 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.85 
 
 
182 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.38 
 
 
331 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  47.85 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  47.13 
 
 
180 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  51.77 
 
 
171 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  49.69 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
337 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.8 
 
 
341 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.32 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.65 
 
 
174 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.83 
 
 
334 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.32 
 
 
166 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.68 
 
 
167 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.05 
 
 
171 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  41.24 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  43.03 
 
 
168 aa  131  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  49.64 
 
 
309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.45 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  46.38 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  44.3 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  41.24 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  47.86 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  42.86 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  42.14 
 
 
158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  41.18 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.29 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.68 
 
 
188 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  44.68 
 
 
188 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  44.68 
 
 
188 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  47.83 
 
 
153 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  43.97 
 
 
171 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  39.13 
 
 
184 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.97 
 
 
171 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  39.13 
 
 
184 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  39.08 
 
 
171 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  43.17 
 
 
157 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  39.67 
 
 
184 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.55 
 
 
179 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  38.51 
 
 
186 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  46.76 
 
 
160 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  38.51 
 
 
171 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.32 
 
 
187 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  40.59 
 
 
171 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  43.66 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.55 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.84 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.73 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.63 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.05 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.84 
 
 
194 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  46.38 
 
 
146 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  47.1 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.25 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.48 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.64 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  42.03 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  43.84 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  39.11 
 
 
166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  39.2 
 
 
164 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  36.02 
 
 
157 aa  84.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  53.52 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  30.07 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.38 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  31.87 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  55.36 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  35.09 
 
 
244 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.54 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.33 
 
 
247 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.93 
 
 
252 aa  61.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.56 
 
 
388 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  32.03 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  33.59 
 
 
397 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  26.97 
 
 
256 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  28.95 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.67 
 
 
239 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  32.58 
 
 
400 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.67 
 
 
239 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.95 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1472  secretion system protein A  29.14 
 
 
243 aa  58.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1511  secretion system protein A  29.14 
 
 
243 aa  58.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  28.74 
 
 
396 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  30.99 
 
 
175 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  28.74 
 
 
406 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  29.21 
 
 
246 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  29.21 
 
 
246 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.97 
 
 
449 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.26 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  32.84 
 
 
504 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  31.58 
 
 
494 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.48 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  29.21 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>