138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1472 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1472  secretion system protein A  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1511  secretion system protein A  99.18 
 
 
243 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1254  hypothetical protein  47.11 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000299618  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1307  putative lipoprotein  47.11 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.46981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  43.15 
 
 
292 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.29 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.14 
 
 
247 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.96 
 
 
244 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  38.36 
 
 
238 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  34.64 
 
 
357 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  36.81 
 
 
244 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  34.48 
 
 
462 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  34.48 
 
 
462 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  37.6 
 
 
406 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  34.48 
 
 
475 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  37.6 
 
 
396 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  34.42 
 
 
355 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  37.6 
 
 
400 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5308  hypothetical protein  35.66 
 
 
415 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.96 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  33.57 
 
 
504 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4794  hypothetical protein  33.8 
 
 
518 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  hitchhiker  0.00337407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  35.2 
 
 
524 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  30.43 
 
 
415 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0510  hypothetical protein  31.79 
 
 
450 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0494741  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 
494 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  34.46 
 
 
502 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  34.11 
 
 
378 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  30.6 
 
 
492 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  35.25 
 
 
481 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  34.46 
 
 
485 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  35.25 
 
 
445 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  36.97 
 
 
477 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  31.37 
 
 
439 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.36 
 
 
449 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  31.87 
 
 
478 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  29.57 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  30.57 
 
 
409 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  37.29 
 
 
487 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.69 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.37 
 
 
408 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  34.45 
 
 
397 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  31.13 
 
 
412 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  34.64 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.33 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4193  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  34.64 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  34.64 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4116  hypothetical protein  30.97 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  32.37 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.97 
 
 
244 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  30.82 
 
 
403 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  30.14 
 
 
403 aa  81.6  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0542  hypothetical protein  30.4 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0342  hypothetical protein  35.82 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.360607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0346  hypothetical protein  35.82 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0353  hypothetical protein  35.82 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0361  hypothetical protein  35.82 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0351  hypothetical protein  35.82 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.786084 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  29.78 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.58 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.97 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  33.58 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  31.33 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.96 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  34.78 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  34.78 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  38.3 
 
 
171 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.72 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.77 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.59 
 
 
160 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.06 
 
 
331 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.74 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.42 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.14 
 
 
179 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.48 
 
 
167 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30 
 
 
174 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  34.75 
 
 
179 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38 
 
 
337 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.64 
 
 
341 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  26.62 
 
 
182 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  44.16 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  27.61 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  32.41 
 
 
166 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.2 
 
 
409 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
162 aa  52  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  36.78 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  27.66 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>