143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0914 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  34.51 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.03 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  34.93 
 
 		 160 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.1 
 
 		 334 aa  88.2  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.62 
 
 		 171 aa  87.8  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  35.86 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.6 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 		 388 aa  82  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  33.33 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  29.86 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.03 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.94 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.32 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00540082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 		 337 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  30.87 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  31.94 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.86 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  31.94 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  29.86 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  29.86 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  29.86 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.64 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  28.95 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  28.95 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.73 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  28.8 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  29.38 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  30.5 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  29.86 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  29.86 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  29.86 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  29.86 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.05 
 
 		 331 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.19 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.38 
 
 		 331 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  27.89 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  28.19 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  30.61 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  30.41 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  31.79 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  31.79 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.02 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  31.79 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.24 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  29.45 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  30.41 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.87 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.45 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.73 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  28.97 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  28.48 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  27.44 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.79 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.38 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.97 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.38 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  28.29 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  27.5 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  27.04 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.59 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.95 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.08 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  27.97 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  29.09 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.32 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.22 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  28.06 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4221  hypothetical protein  29.86 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00480298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1682  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.412549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.9 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3989  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.86 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 		 411 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4260  hypothetical protein  29.17 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0203289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4281  hypothetical protein  28.97 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0049222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3901  erfK/srfK protein  28.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00361052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.81 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0975  hypothetical protein  27.95 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0886923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.39 
 
 		 345 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0434  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.81 
 
 		 266 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3894  ErfK/SrfK protein  27.89 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000648074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.85 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.39 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1978  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1582  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.93 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00138876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>