174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3487 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 		 341 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  67.36 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  60.32 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  61.87 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.09 
 
 		 331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.84 
 
 		 331 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  57.25 
 
 		 174 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  49.64 
 
 		 187 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.06 
 
 		 175 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  51.02 
 
 		 188 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  48.2 
 
 		 168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  49.28 
 
 		 153 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.8 
 
 		 179 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  46.04 
 
 		 166 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  48.23 
 
 		 166 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  46.04 
 
 		 166 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  43.48 
 
 		 157 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  47.89 
 
 		 184 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.45 
 
 		 192 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  47.89 
 
 		 184 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  45.32 
 
 		 185 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  46.21 
 
 		 184 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  43.45 
 
 		 180 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  47.18 
 
 		 184 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  49.64 
 
 		 189 aa  139  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.04 
 
 		 194 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  45.52 
 
 		 167 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  44.3 
 
 		 171 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  45.56 
 
 		 178 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  45.52 
 
 		 208 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.71 
 
 		 187 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.14 
 
 		 162 aa  136  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  47.14 
 
 		 146 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.64 
 
 		 182 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.88 
 
 		 179 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  48.53 
 
 		 186 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  46.81 
 
 		 171 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.23 
 
 		 169 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.29 
 
 		 171 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.77 
 
 		 171 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  48.2 
 
 		 179 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  41.1 
 
 		 188 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.88 
 
 		 188 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  43.88 
 
 		 188 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  43.88 
 
 		 188 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.88 
 
 		 179 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  43.8 
 
 		 160 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.1 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.45 
 
 		 165 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.71 
 
 		 171 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  43.17 
 
 		 186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.17 
 
 		 209 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.81 
 
 		 166 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  43.88 
 
 		 171 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  45 
 
 		 171 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  45 
 
 		 171 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  39.42 
 
 		 158 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.23 
 
 		 167 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.68 
 
 		 160 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.29 
 
 		 167 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.9 
 
 		 164 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.03 
 
 		 190 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.61 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.7 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.38 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  31.51 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.64 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.6 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.83 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  48 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  37.21 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.73 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  35.85 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  34.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  32.03 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  38.74 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  38.74 
 
 		 239 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0342  hypothetical protein  36.43 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.360607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0361  hypothetical protein  36.43 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0346  hypothetical protein  36.43 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>