190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0571 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
334 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  60.32 
 
 
341 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.64 
 
 
337 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  59.42 
 
 
309 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.46 
 
 
331 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.83 
 
 
331 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.28 
 
 
174 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  50.36 
 
 
187 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  46.48 
 
 
171 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  52.55 
 
 
182 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  44.91 
 
 
168 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  48.2 
 
 
185 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.94 
 
 
192 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.08 
 
 
160 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  48.28 
 
 
167 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.21 
 
 
182 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.29 
 
 
175 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.36 
 
 
166 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  48.2 
 
 
171 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  46.9 
 
 
188 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.83 
 
 
162 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.43 
 
 
209 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  43.98 
 
 
188 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  45.32 
 
 
166 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  45.32 
 
 
166 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  42.86 
 
 
189 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.36 
 
 
169 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.83 
 
 
179 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.36 
 
 
181 aa  136  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  46.38 
 
 
153 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.76 
 
 
187 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  46.04 
 
 
184 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  46.04 
 
 
184 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.94 
 
 
188 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  39.86 
 
 
157 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.55 
 
 
165 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  44.94 
 
 
188 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.88 
 
 
194 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  44.94 
 
 
188 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  45.32 
 
 
184 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  42.21 
 
 
208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.96 
 
 
171 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  45.26 
 
 
160 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  46.43 
 
 
171 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  46.43 
 
 
171 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  46.43 
 
 
186 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  42.76 
 
 
180 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  46.43 
 
 
171 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.48 
 
 
164 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  45.32 
 
 
184 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  46.04 
 
 
166 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.06 
 
 
167 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  41.91 
 
 
171 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.29 
 
 
179 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  46.04 
 
 
164 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  44.93 
 
 
146 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  43.07 
 
 
166 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  39.57 
 
 
160 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.26 
 
 
167 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  45.26 
 
 
179 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.76 
 
 
171 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.44 
 
 
179 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 
171 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  37.96 
 
 
158 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.1 
 
 
190 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  32.7 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  37.4 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.8 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.17 
 
 
247 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.28 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.06 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.8 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  32.32 
 
 
545 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.92 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  30.69 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.26 
 
 
270 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  34.06 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  31.45 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  31.48 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.48 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  30.47 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  33.09 
 
 
439 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  47.95 
 
 
122 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.4 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  41.28 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  35.06 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  33.12 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  34.42 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  31.06 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  37.84 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  39.45 
 
 
494 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  42.25 
 
 
93 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  35.34 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  36.94 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>