185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2684 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  48.47 
 
 
166 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  54.93 
 
 
185 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.68 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  45.71 
 
 
187 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  44.32 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  44.57 
 
 
171 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.52 
 
 
169 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.97 
 
 
194 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.29 
 
 
164 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  60.29 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  44.57 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.45 
 
 
179 aa  137  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  45.29 
 
 
166 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.79 
 
 
181 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  45.29 
 
 
164 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.36 
 
 
171 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  43.82 
 
 
171 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.28 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.68 
 
 
179 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  50.72 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.92 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.41 
 
 
165 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  46.63 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.74 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.26 
 
 
334 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.68 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.52 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.29 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.35 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  42.58 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  52.14 
 
 
179 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  48.2 
 
 
171 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  50.38 
 
 
180 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.48 
 
 
174 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  44.2 
 
 
157 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45.66 
 
 
171 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  44.24 
 
 
166 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  45.45 
 
 
166 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.68 
 
 
331 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.21 
 
 
337 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  50.74 
 
 
146 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.23 
 
 
341 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.56 
 
 
331 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  48.95 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.68 
 
 
187 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  45.59 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  45.7 
 
 
208 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  47.45 
 
 
158 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  46.32 
 
 
160 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  44.64 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.53 
 
 
175 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  48.53 
 
 
178 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.21 
 
 
182 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  45.39 
 
 
184 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  42.5 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  41.21 
 
 
309 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  44.68 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  43.97 
 
 
184 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  44.62 
 
 
189 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  37.11 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.2 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
388 aa  70.5  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  49.3 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.11 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  34.13 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.67 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  32.28 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.27 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  34.82 
 
 
244 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  57.63 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.8 
 
 
449 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.22 
 
 
239 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.31 
 
 
247 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  28.4 
 
 
256 aa  62  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.88 
 
 
281 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1307  putative lipoprotein  35.07 
 
 
233 aa  60.8  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.46981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  32.88 
 
 
281 aa  60.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  39.36 
 
 
494 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.63 
 
 
239 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1254  hypothetical protein  35.07 
 
 
233 aa  60.8  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000299618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  35.71 
 
 
439 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  52.73 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  35.05 
 
 
397 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  37.23 
 
 
487 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  38.3 
 
 
478 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  38.3 
 
 
485 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  38.3 
 
 
477 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.71 
 
 
213 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1472  secretion system protein A  36.56 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1511  secretion system protein A  36.56 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  36.84 
 
 
462 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  36.84 
 
 
475 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.910314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>