188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1820 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 179 aa  376  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  74.68 
 
 		 194 aa  265  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  77.5 
 
 		 179 aa  265  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  77.92 
 
 		 171 aa  263  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  68.57 
 
 		 171 aa  262  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  68.57 
 
 		 171 aa  262  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  66.48 
 
 		 186 aa  261  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  68 
 
 		 171 aa  261  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.29 
 
 		 171 aa  254  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  66.29 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  69.81 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  69.81 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  69.81 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  66.88 
 
 		 181 aa  235  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.15 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  66.67 
 
 		 165 aa  224  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  52.78 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.39 
 
 		 171 aa  164  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  48.55 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  55.47 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  50.69 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  51.75 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  51.39 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  54.01 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  46.54 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  47.3 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  47.86 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.02 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  41.36 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  40.46 
 
 		 180 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  42.59 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.48 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  45.71 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  134  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.75 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  40.25 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.87 
 
 		 331 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.76 
 
 		 171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.88 
 
 		 341 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.6 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.71 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  47.79 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.56 
 
 		 331 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.13 
 
 		 337 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.68 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.44 
 
 		 334 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  47.14 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  43.88 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  43.88 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  43.88 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  37.91 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.79 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.53 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.58 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  40 
 
 		 309 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.8 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  35.59 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  35.56 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  40.29 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  38.73 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.44 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  41.18 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  41.18 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.86 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.61 
 
 		 209 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.1 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  32.7 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.86 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.45 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  58.18 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.48 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  27.67 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.67 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.39 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.01 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.83 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  38.38 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  26.58 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.76 
 
 		 241 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.12 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.01 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.64 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.1 
 
 		 429 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.74 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.69 
 
 		 270 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.68 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00540082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.69 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  33.91 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  33.91 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  33.91 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  30.4 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  30.23 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.56 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>