135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3005 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
415 aa  861    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.34 
 
 
413 aa  279  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.62 
 
 
431 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.38 
 
 
414 aa  236  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.92 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.68 
 
 
642 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.03 
 
 
374 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.31 
 
 
437 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.53 
 
 
499 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.47 
 
 
375 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.73 
 
 
442 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 
409 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  28.1 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.25 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.58 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 
822 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  29.89 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.72 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  27.62 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  27.23 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.51 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.68 
 
 
171 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  28.18 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  21.69 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  31.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.39 
 
 
167 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  25.24 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  25.24 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  30.28 
 
 
146 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  25.24 
 
 
325 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.69 
 
 
179 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  31.06 
 
 
171 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  30.43 
 
 
186 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.69 
 
 
181 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  30.43 
 
 
171 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.28 
 
 
179 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  28.87 
 
 
157 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.17 
 
 
171 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  28.86 
 
 
160 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  35.71 
 
 
462 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.46 
 
 
194 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  35.71 
 
 
462 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  31.11 
 
 
187 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  35.71 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  32.65 
 
 
238 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  34.52 
 
 
524 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4794  hypothetical protein  34.52 
 
 
518 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  hitchhiker  0.00337407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 
192 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  32.1 
 
 
184 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  34.07 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  31.87 
 
 
545 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.87 
 
 
165 aa  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  30.41 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  35.16 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  31.48 
 
 
478 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  34.07 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.73 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  31.48 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  30 
 
 
166 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  31.48 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  27.66 
 
 
166 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  30 
 
 
164 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.83 
 
 
164 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  34.07 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  25.17 
 
 
481 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0510  hypothetical protein  31.13 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0494741  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  26.06 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  34.07 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  28.17 
 
 
160 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5308  hypothetical protein  30.77 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  30.56 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  34.91 
 
 
158 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  27.88 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  30.84 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  34 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  31.48 
 
 
184 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  34.52 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  34 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  34.31 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.67 
 
 
247 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.45 
 
 
171 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  33 
 
 
412 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.21 
 
 
175 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  31.48 
 
 
247 aa  47  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  31.87 
 
 
397 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  31.48 
 
 
492 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.66 
 
 
337 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.08 
 
 
331 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.85 
 
 
252 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0542  hypothetical protein  31.87 
 
 
407 aa  47  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.97 
 
 
190 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  37.36 
 
 
244 aa  46.6  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.87 
 
 
449 aa  46.6  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  32.67 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.66 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>