74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4656.3 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  62.5 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  66.1 
 
 		 157 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  67.27 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  59.02 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  61.82 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  58.18 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  58.18 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  58.18 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  58.18 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  56.25 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  58.18 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  56.36 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.36 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  56.36 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  56.36 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  55.17 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  52.73 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  54.55 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  59.62 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  60.71 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  60 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  57.63 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.55 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.73 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  54.24 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  53.7 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.7 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.21 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.36 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  50.88 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  56.36 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.55 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 		 334 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  52.63 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  47.46 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  52.73 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  49.15 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.43 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  46.94 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  42.37 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.7 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  43.64 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.37 
 
 		 337 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.68 
 
 		 187 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  40.68 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  40.68 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.68 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  37.29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.3 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  38.98 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  42.37 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.07 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  49.09 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  39.66 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.33 
 
 		 241 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.68 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  48.21 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  40.38 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  38.18 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.61 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.28 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.62 
 
 		 388 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  33.8 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>