131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2461 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.11 
 
 		 429 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.47 
 
 		 442 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.44 
 
 		 432 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.31 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 		 822 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.92 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  32.07 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  28.38 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.48 
 
 		 365 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  33.48 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.86 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  33.04 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  33.04 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  33.04 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  28.46 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.54 
 
 		 413 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  29.89 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  31.02 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.67 
 
 		 414 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.61 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.72 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.39 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.72 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.5 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.47 
 
 		 642 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  35.51 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  35.51 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.99 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.58 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  30.59 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.46 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  28.47 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  34.34 
 
 		 494 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  36.89 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  36.89 
 
 		 355 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  34.34 
 
 		 477 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  29.27 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  33.04 
 
 		 171 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  33.33 
 
 		 478 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 492 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 485 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  33.01 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  33.01 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  32.04 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  26.47 
 
 		 475 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.62 
 
 		 171 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  26.47 
 
 		 462 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  30.68 
 
 		 175 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  29.13 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  26.47 
 
 		 462 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  28.67 
 
 		 378 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  32.32 
 
 		 487 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5308  hypothetical protein  34.29 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  32.05 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  29.7 
 
 		 167 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 449 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.01 
 
 		 179 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  33.59 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  27.56 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.24 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  32.56 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.37 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  31.39 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.68 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.6 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  30.26 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.26 
 
 		 175 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 		 179 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  30.26 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.65 
 
 		 174 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  32.22 
 
 		 545 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  31.91 
 
 		 171 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.01 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 		 167 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.47 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0510  hypothetical protein  32.32 
 
 		 450 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0494741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  29.21 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  29.61 
 
 		 184 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.56 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  28.46 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  32.1 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  30 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  30.93 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  28.46 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  28.24 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  28.46 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.46 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  31.11 
 
 		 524 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  30.83 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>