94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2067 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2067  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2057  hypothetical protein  96.91 
 
 
162 aa  318  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  42.75 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.48 
 
 
175 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  41.98 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  39.58 
 
 
171 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.52 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  42.52 
 
 
171 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  31.47 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  27.01 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  25.16 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  29.71 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  30.22 
 
 
184 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  28.89 
 
 
184 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  32.87 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.1 
 
 
337 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  27.85 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.84 
 
 
331 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  28.78 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.34 
 
 
331 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  27.52 
 
 
166 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  30.25 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.14 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.66 
 
 
341 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  32.76 
 
 
309 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  28.46 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  32.31 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 
334 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  27.54 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.88 
 
 
642 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  31.2 
 
 
182 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.5 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  28.67 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  26.86 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  27.64 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  27.86 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.4 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  26.06 
 
 
246 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  26.06 
 
 
246 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.76 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.06 
 
 
209 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  26.85 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  26.06 
 
 
246 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.89 
 
 
181 aa  47.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  27.48 
 
 
160 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  27.97 
 
 
179 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  29.17 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.91 
 
 
374 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.31 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.24 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.67 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  25.6 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  32 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.7 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.97 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.07 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  26.45 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  29.06 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.25 
 
 
414 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  29.41 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.33 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  29.57 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.21 
 
 
437 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.47 
 
 
375 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.63 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  28.33 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  28.33 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.26 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00540082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.86 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  28.47 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.72 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 
249 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.56 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  26.57 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  25.19 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  25.19 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  25.5 
 
 
246 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  28.16 
 
 
256 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.21 
 
 
167 aa  40.8  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>