146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0486 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  78.46 
 
 		 492 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1029    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.511704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  65.33 
 
 		 477 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  63.51 
 
 		 478 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  62.94 
 
 		 494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  63.08 
 
 		 487 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  62.87 
 
 		 485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0510  hypothetical protein  59.38 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0494741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4595  hypothetical protein  55.56 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  54.14 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  52.68 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  48.95 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  52.68 
 
 		 462 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  52.68 
 
 		 475 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4794  hypothetical protein  49.26 
 
 		 518 aa  323  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  hitchhiker  0.00337407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  56.64 
 
 		 412 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4116  hypothetical protein  49.85 
 
 		 335 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  50.53 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  53.5 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  46.99 
 
 		 355 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  53.51 
 
 		 403 aa  312  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  53.14 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  50 
 
 		 545 aa  299  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0542  hypothetical protein  46.5 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  57.85 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  49.47 
 
 		 415 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  47.74 
 
 		 378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  48.55 
 
 		 409 aa  286  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4193  hypothetical protein  45.76 
 
 		 364 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.19 
 
 		 408 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4457  hypothetical protein  43.03 
 
 		 396 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.821802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4921  hypothetical protein  43.53 
 
 		 406 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  46.91 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5308  hypothetical protein  49.82 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4971  protein of unknown function DUF949  44.04 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.778266  normal  0.0128256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0041  putative lipoprotein  51.28 
 
 		 247 aa  273  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1046  hypothetical protein  45.49 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  48.31 
 
 		 238 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.83 
 
 		 247 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.38 
 
 		 241 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  43.63 
 
 		 244 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  42.93 
 
 		 246 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  42.93 
 
 		 246 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.84 
 
 		 249 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.38 
 
 		 244 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  42.42 
 
 		 246 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  42.33 
 
 		 256 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3464  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  42.25 
 
 		 239 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00219  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3383  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0267  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00223  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0256  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0235  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3632  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  42.25 
 
 		 239 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.91 
 
 		 244 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0346  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0361  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0342  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.360607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0353  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321045 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0351  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.786084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0761  hypothetical protein  38.86 
 
 		 246 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.72 
 
 		 252 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.56 
 
 		 244 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.98 
 
 		 247 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0637  hypothetical protein  42.98 
 
 		 292 aa  97.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1472  secretion system protein A  34.46 
 
 		 243 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1511  secretion system protein A  34.46 
 
 		 243 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1254  hypothetical protein  32.23 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000299618  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1307  putative lipoprotein  32.23 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.46981e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.12 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  38.53 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.17 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.4 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.44 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  33.82 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.51 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.28 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.39 
 
 		 169 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.58 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  34.41 
 
 		 166 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  31.78 
 
 		 164 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  36.61 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.99 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.94 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  34.71 
 
 		 188 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.71 
 
 		 188 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  34.71 
 
 		 188 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.79 
 
 		 175 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  27.89 
 
 		 309 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  31.39 
 
 		 179 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  24.21 
 
 		 189 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  37.04 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.74 
 
 		 187 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 		 179 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  29.36 
 
 		 187 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>