85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1582 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1582  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00138876  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.27 
 
 
212 aa  187  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00540082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0606  hypothetical protein  45.2 
 
 
177 aa  158  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00152309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.31 
 
 
195 aa  141  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.57 
 
 
281 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  34.57 
 
 
281 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.72 
 
 
241 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  44.83 
 
 
157 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.41 
 
 
331 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.11 
 
 
334 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.44 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.42 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  32.05 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.35 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.52 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  26.97 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  28.48 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.82 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.83 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  27.88 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.67 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  29.11 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  27.07 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  27.07 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
169 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  23.9 
 
 
157 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.81 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  27.6 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  28.49 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  28.8 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.53 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.65 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.26 
 
 
167 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.48 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  28.67 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  33.09 
 
 
309 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  23 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.19 
 
 
166 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  30.46 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.18 
 
 
388 aa  58.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  26.02 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  25.93 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  25.79 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.08 
 
 
270 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.14 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.04 
 
 
171 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  25.26 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.64 
 
 
181 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  25.4 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.39 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  26.38 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.94 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  25.65 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  26.8 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  23.91 
 
 
158 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.48 
 
 
160 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  27.41 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  22.47 
 
 
160 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.41 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  27.41 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  26.49 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  26.14 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.22 
 
 
228 aa  51.2  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.64 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  26.14 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.64 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.29 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.41 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  24.36 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  27.41 
 
 
171 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  26.14 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  27.21 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  28.36 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  25.69 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  25.13 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  26.81 
 
 
208 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25 
 
 
175 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.18 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2067  hypothetical protein  25.41 
 
 
162 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>