161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3266 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3266  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 89 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.994662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1310  hypothetical protein  56.41 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2970  surface presentation of antigens (SPOA) protein  56.41 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.450675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2743  surface presentation of antigens (SPOA) protein  54.65 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.207596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2945  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50.6 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  45.95 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  37.33 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  42.11 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.36 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  42.67 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  42.67 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  38.16 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  36.96 
 
 		 180 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  35 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  39.19 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.71 
 
 		 398 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  38.89 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.18 
 
 		 357 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  41.1 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  39.19 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  37.84 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  40 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.16 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  31.4 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  31.4 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  36.49 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  35.16 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  40.54 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  34.62 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  34.62 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  38.46 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  38.46 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  32.94 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  41.89 
 
 		 246 aa  48.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  38.36 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.43 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  33.33 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  38.67 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  33.78 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  33.78 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  38.67 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  38.67 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  35.9 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  31.46 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  34.57 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  37.18 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  32.05 
 
 		 194 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  38.67 
 
 		 250 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.57 
 
 		 422 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  31.76 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  31.76 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  31.76 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  35.14 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  34.21 
 
 		 393 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  33.75 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  34.74 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  37.66 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  35.9 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  35.9 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  34.57 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  36.36 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  33.72 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  34.62 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  38.67 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  34.62 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  34.72 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  34.62 
 
 		 401 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  33.68 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  36 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  33.77 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  34.62 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  36 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>