More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1829 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 464 aa  962    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  71.43 
 
 		 466 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  70.58 
 
 		 466 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  62.67 
 
 		 472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  62.67 
 
 		 473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  62 
 
 		 471 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  67.56 
 
 		 463 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  64.18 
 
 		 464 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  60.89 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  62.42 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  58.94 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  59.91 
 
 		 479 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  63.04 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  60.84 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  54.66 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  54.66 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  40.48 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  36.63 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 433 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  28.78 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.14 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.35 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.35 
 
 		 430 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.35 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 424 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 428 aa  153  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.63 
 
 		 438 aa  153  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 436 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  29.68 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  28.57 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  28.64 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.34 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  30.65 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  30.65 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  30.81 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  29 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 428 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  29.71 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 428 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>