More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1726 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1726  beta-hexosamidase  100 
 
 		 328 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.18 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4411  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.97 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1484  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.33 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.760181  normal  0.558112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.45 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4420  putative sugar hydrolase/Beta-N-acetylhexosaminidase  52.12 
 
 		 342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0905  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.31 
 
 		 353 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1682  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0904  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.91 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.0636434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1760  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.39 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1810  glycoside hydrolase family protein  51.11 
 
 		 343 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  50.31 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.02 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1912  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.26 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1868  Beta-N-acetylhexosaminidase  54.25 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376084  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1160  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.97 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0839942  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3589  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.7 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.806874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.1 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.1 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3024  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.76 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2793  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.28 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0138787  normal  0.035915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  48.05 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2765  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.53 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2748  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.88 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.79 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0603472  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2941  putative glycoside hydrolase  54.88 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.33 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2348  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.24 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1586  Beta-N-acetylhexosaminidase  53.99 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.245014 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0870  glycosy hydrolase family protein  43.64 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0879  glycosy hydrolase family protein  43.64 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.28 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2673  glycosyl hydrolase  49.49 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1777  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.53 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.03 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.57 
 
 		 308 aa  238  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5779  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.45 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.028314  normal  0.0213376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0951  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.54 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6683  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.51 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.613122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3933  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.58 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  40.84 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.08 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.08 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.37 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  38.55 
 
 		 365 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.41 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.24 
 
 		 478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.94 
 
 		 511 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  35.84 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.77 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  36.04 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  33.43 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  34.53 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  33.43 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  35.92 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  35.92 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  34.23 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.78 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  35.92 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  31.4 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  34.53 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  35.77 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.92 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.38 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  35.94 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  33.77 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  35.46 
 
 		 637 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.77 
 
 		 528 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  34.41 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  34.41 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  34.41 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  34.41 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  34.41 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  33.44 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  35.16 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 		 633 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.44 
 
 		 490 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.13 
 
 		 517 aa  132  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  34.84 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  32.48 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.42 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  35.11 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  33.63 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.21 
 
 		 363 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.23 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.4 
 
 		 504 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  34.63 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  33.22 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 444 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  34.17 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  32.83 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  32.87 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  35.2 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  31.82 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  35.1 
 
 		 734 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.1 
 
 		 698 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>