251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1539 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  100 
 
 
318 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3171  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  55.7 
 
 
327 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.71951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  47.44 
 
 
320 aa  255  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  48.28 
 
 
310 aa  248  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2477  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  50.83 
 
 
334 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0302192  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.37 
 
 
307 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  47.13 
 
 
364 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.71 
 
 
314 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.71 
 
 
314 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  47.25 
 
 
316 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.71 
 
 
314 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.71 
 
 
314 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  49.83 
 
 
320 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  47.39 
 
 
316 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.08 
 
 
316 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.08 
 
 
316 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.78 
 
 
316 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  51.11 
 
 
305 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.62 
 
 
310 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  45.57 
 
 
309 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.57 
 
 
357 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47 
 
 
357 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.64 
 
 
350 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  47.92 
 
 
310 aa  225  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  48.17 
 
 
321 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.11 
 
 
314 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  50.48 
 
 
305 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  42.52 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  47.28 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  48.94 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  41.67 
 
 
323 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.91 
 
 
367 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  42.77 
 
 
332 aa  215  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.99 
 
 
322 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.79 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1174  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  48.84 
 
 
304 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.6 
 
 
357 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1616  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  48.3 
 
 
312 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0642  Na+/Ca+ antiporter  46.25 
 
 
312 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.81 
 
 
358 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.51 
 
 
319 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.14 
 
 
321 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.77 
 
 
369 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.76 
 
 
322 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.13 
 
 
358 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.79 
 
 
325 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  42.47 
 
 
321 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.65 
 
 
316 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.28 
 
 
368 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.31 
 
 
325 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45.28 
 
 
324 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.64 
 
 
325 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1716  Ca2+/H+ antiporter  44.69 
 
 
361 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0816258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.12 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.81 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4287  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.33 
 
 
343 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.35 
 
 
323 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.72 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.72 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  41.72 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.59 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1602  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.05 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  40.6 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  46.03 
 
 
369 aa  196  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2416  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.81 
 
 
324 aa  195  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0778  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.25 
 
 
329 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.020554  normal  0.0984265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.43 
 
 
324 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.53 
 
 
320 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.41 
 
 
323 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41 
 
 
367 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  39.49 
 
 
326 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  36.73 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.05 
 
 
326 aa  189  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0372  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  48 
 
 
365 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0935  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.12 
 
 
341 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  44.34 
 
 
325 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  37.23 
 
 
331 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.42 
 
 
324 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  47.6 
 
 
274 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0192504  normal  0.0940399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  40.38 
 
 
318 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.01 
 
 
324 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0833  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger protein  41.55 
 
 
353 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168882  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.97 
 
 
309 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.97 
 
 
309 aa  186  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.53 
 
 
320 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4477  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.57 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4168  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0928  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.21 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.392907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0968  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.67 
 
 
347 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.798844  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  35.6 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.73 
 
 
320 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.07 
 
 
328 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4048  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.54 
 
 
316 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.242583  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0430  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.7 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0905  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.72 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  36.96 
 
 
326 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.92 
 
 
327 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.01 
 
 
325 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.62 
 
 
361 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.2 
 
 
329 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>