More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2463 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 604 aa  1249    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  46.91 
 
 		 599 aa  552  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  46.9 
 
 		 599 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.53 
 
 		 614 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.89 
 
 		 626 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.67 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.38 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.78 
 
 		 599 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.63 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.47 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.47 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.47 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.47 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.47 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.63 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.47 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.2 
 
 		 571 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.48 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  35.97 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.46 
 
 		 600 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.78 
 
 		 611 aa  364  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  41.74 
 
 		 598 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.56 
 
 		 600 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  41.54 
 
 		 583 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  41.54 
 
 		 582 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.62 
 
 		 587 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  40.8 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  40.92 
 
 		 604 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.79 
 
 		 613 aa  343  7e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.07 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.92 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.86 
 
 		 604 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  32.84 
 
 		 606 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.27 
 
 		 544 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  32.34 
 
 		 596 aa  320  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  36.51 
 
 		 588 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.91 
 
 		 590 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.49 
 
 		 590 aa  317  6e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  42.93 
 
 		 655 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.63 
 
 		 660 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  42.93 
 
 		 651 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  38.15 
 
 		 676 aa  312  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  32.94 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  42.4 
 
 		 652 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  34.33 
 
 		 675 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.43 
 
 		 623 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  43.88 
 
 		 578 aa  310  5e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  36.69 
 
 		 630 aa  310  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  44.29 
 
 		 572 aa  310  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  44.29 
 
 		 553 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  40.05 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.78 
 
 		 703 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  42.74 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.67 
 
 		 660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  38.35 
 
 		 646 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  42.48 
 
 		 664 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  38.35 
 
 		 646 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  39.3 
 
 		 581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.91 
 
 		 656 aa  307  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.51 
 
 		 660 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.4 
 
 		 660 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  39.58 
 
 		 613 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.25 
 
 		 660 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  37.65 
 
 		 636 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.11 
 
 		 584 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  36.07 
 
 		 632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  32.9 
 
 		 640 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.82 
 
 		 619 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  39.05 
 
 		 581 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  39.05 
 
 		 581 aa  303  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  39.3 
 
 		 584 aa  302  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.13 
 
 		 638 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  32.67 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  41.36 
 
 		 663 aa  301  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  41.78 
 
 		 595 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  35.84 
 
 		 593 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37.97 
 
 		 694 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  32.2 
 
 		 595 aa  299  9e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  42.69 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.68 
 
 		 617 aa  299  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  35.05 
 
 		 662 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  30.91 
 
 		 605 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  30.91 
 
 		 605 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.41 
 
 		 640 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  35.73 
 
 		 626 aa  296  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  40.5 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  38.29 
 
 		 592 aa  296  9e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  32.96 
 
 		 660 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  32.99 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>