101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2206 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  100 
 
 		 539 aa  1098    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  36.24 
 
 		 608 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  34.78 
 
 		 612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  34.22 
 
 		 821 aa  297  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  32.83 
 
 		 614 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  34.53 
 
 		 581 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  33.33 
 
 		 570 aa  276  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.74 
 
 		 598 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  37.76 
 
 		 616 aa  270  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  31.96 
 
 		 558 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  30.42 
 
 		 592 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  30.49 
 
 		 592 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  29.59 
 
 		 592 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  35.35 
 
 		 615 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  31.92 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  30.93 
 
 		 610 aa  253  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  35.93 
 
 		 611 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.24 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  31.98 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  36.18 
 
 		 638 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  35.83 
 
 		 647 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  29.39 
 
 		 690 aa  240  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  29.33 
 
 		 642 aa  239  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  33.18 
 
 		 647 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.6 
 
 		 612 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  33.15 
 
 		 549 aa  233  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  32.86 
 
 		 635 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  33.81 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  36.3 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  33.25 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  28.96 
 
 		 627 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  35.66 
 
 		 635 aa  226  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  34.24 
 
 		 673 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  34.26 
 
 		 622 aa  224  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  35.78 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  35.1 
 
 		 673 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  29.42 
 
 		 627 aa  223  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  35.1 
 
 		 673 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  31.95 
 
 		 683 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  33.48 
 
 		 694 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  36.52 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  35.35 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  36.3 
 
 		 612 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  33.97 
 
 		 657 aa  213  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  32.94 
 
 		 630 aa  207  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  33.18 
 
 		 679 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.73 
 
 		 650 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  29.49 
 
 		 538 aa  203  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  33.49 
 
 		 417 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  33.73 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  31.07 
 
 		 521 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  32.3 
 
 		 640 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  31.6 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  31.96 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  31.96 
 
 		 640 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  30.23 
 
 		 537 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  29.64 
 
 		 644 aa  193  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  30.3 
 
 		 640 aa  193  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  30.42 
 
 		 652 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  33.5 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  33.09 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  33.07 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  27.27 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.52 
 
 		 554 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  27.19 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.63 
 
 		 685 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.75 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25.78 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  26.22 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  24.53 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.96 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  23.81 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.33 
 
 		 539 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.24 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  42.37 
 
 		 572 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  45.1 
 
 		 572 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 		 575 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.11 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  51.11 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  31.91 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  48.89 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  44 
 
 		 553 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  51.16 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  54.76 
 
 		 571 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.65 
 
 		 410 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.65 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  46.67 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.38 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  40.82 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  41.67 
 
 		 574 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.38 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  35.23 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0800  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.91 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.58 
 
 		 407 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.38 
 
 		 407 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.11 
 
 		 407 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.96 
 
 		 328 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0216  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  37.88 
 
 		 113 aa  43.5  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.77 
 
 		 408 aa  43.5  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>