More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0779 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.5 
 
 
275 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.95 
 
 
275 aa  348  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.266934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.91 
 
 
276 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.874782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 
275 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 
273 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 
276 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00790597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.14 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 
286 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0035  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 
273 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000656288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4777  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.42 
 
 
276 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 
283 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000197735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 
384 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
292 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
285 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000136798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1840  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.88 
 
 
415 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4636  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
356 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 
614 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.355642  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
897 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2843  chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 
397 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.565523  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
656 aa  93.2  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
527 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
527 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  44.53 
 
 
661 aa  92.4  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
527 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
625 aa  92  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  39.13 
 
 
528 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  40.16 
 
 
655 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 
649 aa  91.3  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
627 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 
523 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  40.16 
 
 
655 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
579 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
579 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.18 
 
 
433 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  41.06 
 
 
620 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
579 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0277282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 
579 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.154062  normal  0.0682347 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  41.13 
 
 
651 aa  90.1  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 
638 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  36.53 
 
 
604 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.9 
 
 
628 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.421462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
431 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.87 
 
 
525 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 
626 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 
620 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 
620 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 
708 aa  89.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
624 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  36.65 
 
 
663 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 
620 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
650 aa  89.4  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 
558 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  40.15 
 
 
643 aa  89  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
550 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
523 aa  89  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
541 aa  89  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  33.53 
 
 
771 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  26.53 
 
 
880 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
523 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  38.64 
 
 
654 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  43.36 
 
 
641 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
654 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 
705 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  38.86 
 
 
653 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  38.29 
 
 
394 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
720 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 
707 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  39.73 
 
 
626 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  39.1 
 
 
654 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
621 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 
686 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  42.28 
 
 
566 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  34.42 
 
 
656 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  30.41 
 
 
689 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  38.64 
 
 
656 aa  87.8  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 
598 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
620 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 
499 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1394  chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 
444 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  34.32 
 
 
535 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  35.03 
 
 
653 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.48 
 
 
879 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 
568 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  30.81 
 
 
394 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  34.74 
 
 
564 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  36.9 
 
 
568 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 
548 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
720 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1175  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
526 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
548 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39560  putative chemotaxis transducer  32.67 
 
 
431 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
539 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>