71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3242 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  868    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.15 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.22 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.22 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.02 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  30.09 
 
 		 756 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.08 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.62 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.88 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  25.63 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.44 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.33 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.36 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.33 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  25.8 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.27 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.32 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.19 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  24.39 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.47 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  26.87 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.46 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.33 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  25.08 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.19 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.82 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.95 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.51 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  25.75 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  21.63 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  26.85 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  26.72 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  26.72 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 914 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.96 
 
 		 891 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.23 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 900 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.91 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.63 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  29.87 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 900 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24.77 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.03 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  28.89 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.58 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  23.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1516  D-alanine--D-alanine ligase  24.79 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.1 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  25.58 
 
 		 327 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  27.44 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  28.66 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.66 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.66 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.85 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.52 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  26.32 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  24.81 
 
 		 912 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.22 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.19 
 
 		 924 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 926 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  23.83 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.77 
 
 		 541 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  23.83 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  18.96 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 904 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.53 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  27.93 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.31 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  30.11 
 
 		 581 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  29.09 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>