More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3100 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  100 
 
 		 652 aa  1325    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  65.02 
 
 		 650 aa  874    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  46.99 
 
 		 644 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  41.86 
 
 		 638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  40.49 
 
 		 640 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  43.32 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  40.49 
 
 		 640 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  40.49 
 
 		 640 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  40.18 
 
 		 640 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  41.12 
 
 		 627 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  40.94 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  41.12 
 
 		 622 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  39.7 
 
 		 657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  37.91 
 
 		 647 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  38.98 
 
 		 642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  38.58 
 
 		 635 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  37.38 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  36.28 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.44 
 
 		 618 aa  364  3e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  33.83 
 
 		 647 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  38.57 
 
 		 512 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  32.7 
 
 		 614 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  34.01 
 
 		 615 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  33.28 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  36.69 
 
 		 535 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  33.85 
 
 		 627 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  35.11 
 
 		 537 aa  327  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  31.81 
 
 		 821 aa  326  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  35.15 
 
 		 521 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  33.66 
 
 		 616 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  30.49 
 
 		 673 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  31.11 
 
 		 673 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  31.26 
 
 		 673 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  31.83 
 
 		 612 aa  300  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  29.85 
 
 		 694 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  31.61 
 
 		 615 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  30.83 
 
 		 611 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.59 
 
 		 683 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  30.4 
 
 		 690 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  32.96 
 
 		 592 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  33.17 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  32.37 
 
 		 592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.88 
 
 		 679 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  31.92 
 
 		 610 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  32.68 
 
 		 592 aa  282  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  31.27 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  29.03 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.27 
 
 		 581 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  29.08 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  29.26 
 
 		 558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  29.78 
 
 		 612 aa  232  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  28.8 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.99 
 
 		 417 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.55 
 
 		 424 aa  195  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.75 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  30.34 
 
 		 427 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  30.42 
 
 		 539 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  31.71 
 
 		 538 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  29.93 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  31.44 
 
 		 416 aa  170  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  30.84 
 
 		 410 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  26.35 
 
 		 555 aa  146  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.13 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.69 
 
 		 685 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.91 
 
 		 554 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.72 
 
 		 540 aa  107  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  23.78 
 
 		 541 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  24.47 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  25.67 
 
 		 514 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25.5 
 
 		 540 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.25 
 
 		 539 aa  97.4  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  25.37 
 
 		 530 aa  94.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.15 
 
 		 535 aa  91.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  21.32 
 
 		 639 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.63 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  39.29 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.05 
 
 		 375 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.1 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  26.17 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.48 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  41.05 
 
 		 101 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  26.06 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.05 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  29.31 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  23.92 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  31.03 
 
 		 379 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.15 
 
 		 372 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.47 
 
 		 354 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.52 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.47 
 
 		 354 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.52 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.43 
 
 		 351 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  34.34 
 
 		 111 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  34.52 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  36.63 
 
 		 113 aa  55.5  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.52 
 
 		 382 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>