More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_515 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  83.25 
 
 		 383 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  100 
 
 		 382 aa  801    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  80.11 
 
 		 380 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  44.57 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  38.81 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  35.03 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  33.85 
 
 		 409 aa  215  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  30.06 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  32.68 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  32.12 
 
 		 374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  29.3 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  29.13 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  30.6 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  28.13 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  28.7 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  29.86 
 
 		 374 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  26.74 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.11 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  28.25 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  27.23 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 		 377 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  27.4 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  27 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  24.36 
 
 		 362 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4480  aminotransferase  25.37 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  27.22 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  26.48 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  26.3 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  28.62 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  26.86 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  27.63 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  26.64 
 
 		 374 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  26.07 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  25.77 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  24.04 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  27.34 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  26.43 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  24.77 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  23.72 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  25.21 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  25.84 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  23.68 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  25.35 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  24.69 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  26.01 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  23.36 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07471  aminotransferases class-I  26.62 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.503554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  25.74 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  24.74 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  26.69 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  26.9 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  22.76 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  25.97 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  24.85 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  24.41 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  25.41 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  27.43 
 
 		 389 aa  99.4  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  25.66 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  23.72 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  24.28 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  23.12 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  24.2 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  25.81 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  24.16 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  32.65 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  27.97 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  24.48 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  24.36 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  26.79 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  23.7 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  24.13 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  24.61 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  23.5 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  25.07 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  24.09 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  23.93 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  26.26 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  25.45 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  24.92 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  25 
 
 		 456 aa  93.2  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  25.45 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  24.32 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  24.92 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  24.46 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  26.06 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  24.84 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  23.13 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  26.73 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  26.33 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  24.32 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  25 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  24.92 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  23.15 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  27.71 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  23.1 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>