More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0018 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  74.02 
 
 		 487 aa  748    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0018  ABC transporter related  100 
 
 		 488 aa  1002    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  74.54 
 
 		 487 aa  742    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  39.83 
 
 		 544 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  38.51 
 
 		 534 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  38.57 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  39.2 
 
 		 544 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 544 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  39.62 
 
 		 544 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  39.62 
 
 		 544 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 		 544 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 522 aa  292  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 540 aa  292  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1598  ABC transporter related  34.51 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  32.03 
 
 		 548 aa  246  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.75 
 
 		 542 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  31.21 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 543 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  32.44 
 
 		 542 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  35.64 
 
 		 640 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  31.96 
 
 		 569 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  34.15 
 
 		 644 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  30.86 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.82 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  28.99 
 
 		 577 aa  199  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  27.82 
 
 		 619 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  30.43 
 
 		 577 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  30.71 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  33.42 
 
 		 564 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  30.87 
 
 		 630 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  33.92 
 
 		 575 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  31.7 
 
 		 667 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.07 
 
 		 636 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 629 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.42 
 
 		 641 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  32.07 
 
 		 529 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.51 
 
 		 709 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 644 aa  190  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6356  putative ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 550 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.74 
 
 		 580 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.05 
 
 		 636 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.74 
 
 		 690 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.73 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.52 
 
 		 643 aa  188  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 627 aa  188  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  28.68 
 
 		 654 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  31.87 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  31.88 
 
 		 642 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  31.88 
 
 		 642 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  31.68 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  33.16 
 
 		 564 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  30.61 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  28.99 
 
 		 613 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.05 
 
 		 630 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2194  ABC transporter related  28.75 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  27.95 
 
 		 630 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.07 
 
 		 549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2529  ABC transporter-related protein  28.83 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0334  ABC transporter related protein  29.25 
 
 		 606 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  32.04 
 
 		 634 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0517  ATPase component of ABC transporter  31.23 
 
 		 352 aa  183  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 		 550 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  28.86 
 
 		 637 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  28.86 
 
 		 637 aa  183  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  28.86 
 
 		 637 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  27.37 
 
 		 528 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.21 
 
 		 668 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  30.22 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  30.33 
 
 		 639 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.77 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  26.48 
 
 		 638 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.41 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  31.76 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  28.34 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.39 
 
 		 634 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  25.46 
 
 		 659 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.49 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  29.98 
 
 		 641 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  31.76 
 
 		 529 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7137  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.76 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  28.25 
 
 		 673 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  28.24 
 
 		 645 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.41 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  31.27 
 
 		 638 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  30.97 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2198  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  31.83 
 
 		 649 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2048  ABC transporter related  28.49 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.671831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.76 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  29 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>