More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1814 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  100 
 
 
513 aa  1060    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  62.65 
 
 
523 aa  680    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  64.79 
 
 
518 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
515 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
515 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  50.68 
 
 
515 aa  531  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  43.53 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  40.9 
 
 
523 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  41.96 
 
 
519 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
514 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  40.23 
 
 
517 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  42.88 
 
 
510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  40.78 
 
 
517 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  40.7 
 
 
517 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
514 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
514 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  40.46 
 
 
517 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
517 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
517 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
517 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  40.46 
 
 
517 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
530 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
513 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  38.88 
 
 
518 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  40.46 
 
 
517 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  38.88 
 
 
518 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  39.26 
 
 
518 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  39.13 
 
 
512 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
517 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  38.68 
 
 
518 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  40.08 
 
 
517 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  40.23 
 
 
518 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 
514 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  39.26 
 
 
518 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 
514 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
514 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  39.19 
 
 
517 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  36.99 
 
 
512 aa  354  2e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
512 aa  347  4e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.71 
 
 
643 aa  335  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  35.09 
 
 
635 aa  319  9e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  33.4 
 
 
645 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  34.11 
 
 
642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  34.11 
 
 
642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
644 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
662 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  35.51 
 
 
630 aa  303  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
644 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
658 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
640 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
659 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  33.53 
 
 
658 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.15 
 
 
659 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.84 
 
 
649 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
658 aa  300  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.53 
 
 
658 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.76 
 
 
641 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
644 aa  299  8e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
659 aa  299  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  33.72 
 
 
644 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.33 
 
 
658 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  32.3 
 
 
639 aa  296  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  33.78 
 
 
632 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  31.72 
 
 
634 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.11 
 
 
638 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.5 
 
 
581 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.16 
 
 
643 aa  292  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  32.7 
 
 
638 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.21 
 
 
639 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  32.29 
 
 
634 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.05 
 
 
575 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  33.14 
 
 
545 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.98 
 
 
646 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  33.27 
 
 
664 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  33.33 
 
 
544 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  33.4 
 
 
649 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.6 
 
 
549 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
636 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  32.2 
 
 
659 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  33.59 
 
 
541 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.66 
 
 
637 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  34.5 
 
 
630 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
546 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.18 
 
 
636 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.67 
 
 
545 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  33.46 
 
 
627 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.87 
 
 
544 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.06 
 
 
767 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.3 
 
 
645 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.16 
 
 
564 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 
545 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.65 
 
 
690 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.68 
 
 
666 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  32.06 
 
 
540 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  31.3 
 
 
545 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.68 
 
 
543 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  32.82 
 
 
541 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  34.63 
 
 
569 aa  272  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>