More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1796 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1796  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 244 aa  488  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  39.52 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.51 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  43.93 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  50.56 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  50.56 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  50.56 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  50.56 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  36.22 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.28 
 
 		 411 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  37.98 
 
 		 308 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  44.44 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.82 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.84 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  49.44 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  49.44 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  49.44 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  48.31 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  48.31 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.99 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.05 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  41.51 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  37.96 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.99 
 
 		 399 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  42.39 
 
 		 460 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.77 
 
 		 472 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  40 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  42.22 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  42.22 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  41.18 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.86 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  46.15 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  34.68 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  32.12 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  42.53 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.76 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  36.09 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  46.07 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.09 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.72 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  46.07 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  30.41 
 
 		 824 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.66 
 
 		 375 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  37.17 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  42.53 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  35.77 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.53 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  41.11 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  33.03 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  47.19 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  32.8 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.38 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  41.67 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.79 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  47.37 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  40.86 
 
 		 420 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  35.71 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.5 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  42.22 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  40.43 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.29 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  42.39 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  42.2 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  40.43 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  46.07 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  32.19 
 
 		 1019 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  40.43 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.89 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  40.74 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  46.32 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.25 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.36 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  43.82 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  36.36 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  43.82 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.53 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  42.59 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  39.56 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.05 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  46.67 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.36 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  31.18 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.14 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.11 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  45.05 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  34.58 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  38.33 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  40.2 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  40.74 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  40.74 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  36.8 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  36.3 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  32.59 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  31.61 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.14 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.52 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  39.13 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  36.51 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  34.91 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>