More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1539 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 480 aa  979    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 476 aa  569  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 479 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 504 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 493 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 493 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 503 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 500 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 493 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  42.32 
 
 		 495 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 485 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 509 aa  358  8e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 502 aa  348  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 492 aa  346  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 503 aa  345  7e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 502 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 501 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 500 aa  336  5e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 484 aa  332  6e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 506 aa  331  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 490 aa  329  8e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 501 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 512 aa  320  5e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 477 aa  319  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 475 aa  316  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 488 aa  316  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 495 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 469 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 469 aa  309  8e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 488 aa  305  8.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 493 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 503 aa  299  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 489 aa  299  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 485 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 502 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>