149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4893 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 447 aa  934    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  45.56 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  47 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  43.27 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  44.01 
 
 		 474 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  29.33 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  27.65 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  28.51 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  27.85 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  28.87 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  28.28 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  28.34 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 		 453 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  25.4 
 
 		 515 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  26.68 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  26.81 
 
 		 493 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  23.09 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  25.22 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  25.37 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  36.61 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.82 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.89 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  23.21 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  24.08 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  25.94 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.14 
 
 		 513 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  22.26 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  26.02 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.29 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.48 
 
 		 499 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.29 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  26.4 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  27.85 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.79 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  23.27 
 
 		 489 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  23.56 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  26.97 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.43 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  27.44 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.3 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.3 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  23.27 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  23.27 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  23.27 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  23.27 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  34.45 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  31.43 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  24.87 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  25.62 
 
 		 490 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  22.33 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  22.33 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  22.33 
 
 		 511 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  25.13 
 
 		 496 aa  50.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  25.91 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  27.37 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  22.37 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.26 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  21.46 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  22.98 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  28.57 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  26.7 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  21.81 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  24.24 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  22.2 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  22.5 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  22.5 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  23.44 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  26.55 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  21.59 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  31.58 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  21.81 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  21.81 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  25 
 
 		 525 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  21.59 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.92 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.48 
 
 		 512 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.59 
 
 		 499 aa  47  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  25.1 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  25.86 
 
 		 512 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  25.11 
 
 		 495 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  21.6 
 
 		 513 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  25.56 
 
 		 520 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  21.6 
 
 		 513 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  21.38 
 
 		 513 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  25 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  23.04 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.79 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  23.08 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  26.16 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  25.28 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  25.28 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  25.42 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  28.49 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  26.16 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  25.32 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  23.53 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  20.25 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0884  carbohydrate kinase FGGY  25.44 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  21.43 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.2 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>