282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3949 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
367 aa  754    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  46.34 
 
 
375 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
366 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
381 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  26.23 
 
 
387 aa  110  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  25.76 
 
 
373 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  27.03 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  23.39 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  24.43 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
445 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  24.03 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  26.73 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
420 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1087  hypothetical protein  21.14 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
409 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
397 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
369 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.71 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.81 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  21.31 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
463 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  32.95 
 
 
557 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  19.44 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.73 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  21.1 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  32.89 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  27.81 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
408 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  21.75 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  25.33 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.98 
 
 
405 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  27.04 
 
 
654 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
403 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.18 
 
 
2401 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  34.48 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  19.06 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0777  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.135676  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
422 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 
382 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 
379 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
406 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  20.79 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  20.79 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
422 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>