More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3027 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.87 
 
 
286 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 
425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
284 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 
279 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
279 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.78 
 
 
296 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  28.46 
 
 
296 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
283 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.46 
 
 
296 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.46 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.2 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  31.51 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
287 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
273 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.8 
 
 
279 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
239 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
265 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
279 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
273 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
265 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
263 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
265 aa  99  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  27.31 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
310 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  25.67 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
397 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
220 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
278 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
267 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  28.32 
 
 
262 aa  85.9  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.27 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  27.05 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  26.57 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.48 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.18 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  24.79 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.2 
 
 
571 aa  75.9  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.2 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  26.22 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.91 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  22.46 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>