71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2449 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 165 aa  343  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  56.57 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  36.36 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  30.46 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.77 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  38.81 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  32.35 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  29.53 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  29.53 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  37.59 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  29.7 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  31.76 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  30.15 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  30.15 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  29.37 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  32.74 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  30.07 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  29.51 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  27.11 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  46.97 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  28.12 
 
 		 266 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  37.5 
 
 		 270 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  30.26 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  29.8 
 
 		 372 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  28.46 
 
 		 377 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0553  hypothetical protein  31.48 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000331234 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B25  hypothetical protein  24.26 
 
 		 231 aa  47.8  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.548873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  30.4 
 
 		 269 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  31.19 
 
 		 435 aa  47.4  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  38.75 
 
 		 382 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  31.19 
 
 		 435 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 355 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 1177 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 359 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0629  hypothetical protein  30.36 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  31.19 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30.28 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1202  UvrD/REP helicase  29.58 
 
 		 1112 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  32.04 
 
 		 366 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  30 
 
 		 272 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  30.58 
 
 		 246 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 386 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  27.52 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  36.25 
 
 		 382 aa  44.3  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4415  hypothetical protein  31.48 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  30.47 
 
 		 285 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3673  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3927  protein of unknown function DUF955  33.01 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 367 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  38.81 
 
 		 370 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  31.03 
 
 		 357 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  28.91 
 
 		 350 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  32.52 
 
 		 294 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  30.77 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0260  protein of unknown function DUF955  33.66 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  29.21 
 
 		 390 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1463  protein of unknown function DUF955  27.78 
 
 		 220 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  26.72 
 
 		 367 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  31.73 
 
 		 302 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  32.46 
 
 		 392 aa  41.2  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.8 
 
 		 355 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 1143 aa  40.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  40.8  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  25.86 
 
 		 367 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>