265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1146 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  100 
 
 
256 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  62.11 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 
254 aa  248  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  47.66 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  45.7 
 
 
255 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 
853 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  40.28 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.92 
 
 
853 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
853 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  34.3 
 
 
241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
750 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
266 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
851 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
851 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  34.35 
 
 
851 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
851 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.35 
 
 
851 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  33.07 
 
 
268 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  31.38 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 
265 aa  111  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
461 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  25.84 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  32.04 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  24.37 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  30.72 
 
 
868 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  40.32 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  46 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
341 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
332 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  47.73 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
201 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
710 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
711 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.87 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  50 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
331 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
1082 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  52.63 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  48 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
328 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
328 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
328 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  42 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  38.24 
 
 
280 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  38 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  42 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  21.65 
 
 
197 aa  48.5  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.82 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.82 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  25.71 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.82 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  44.16 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  28.81 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  51.11 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  40 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  36.67 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  43.48 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  39.73 
 
 
249 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.33 
 
 
238 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.29 
 
 
325 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
511 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 
275 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.86 
 
 
223 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  36 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.71 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>