More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1538 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  59.46 
 
 		 576 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 563 aa  1155    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  60.72 
 
 		 565 aa  685    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  53.75 
 
 		 538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  55.18 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  52.81 
 
 		 538 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  54.95 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  53.63 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  50.38 
 
 		 546 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  50.2 
 
 		 539 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  50.4 
 
 		 540 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 		 551 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  50.52 
 
 		 381 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 		 509 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 508 aa  236  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 555 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  32.76 
 
 		 554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 553 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 		 619 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.18 
 
 		 511 aa  226  9e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.35 
 
 		 511 aa  226  9e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 526 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  31.07 
 
 		 518 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 622 aa  219  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.04 
 
 		 594 aa  216  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1568  oligopeptide-binding protein, putative  64.94 
 
 		 164 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.467595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.4 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.4 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.4 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.25 
 
 		 511 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.2 
 
 		 521 aa  209  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 		 593 aa  204  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.75 
 
 		 511 aa  203  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.45 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.43 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 586 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 		 528 aa  199  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.33 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 		 866 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 		 528 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 600 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 502 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.42 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.85 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 545 aa  194  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 556 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.63 
 
 		 524 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.87 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.22 
 
 		 596 aa  191  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.13 
 
 		 516 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  24.9 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 608 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 524 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.48 
 
 		 509 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.67 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 524 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 595 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 556 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 628 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.1 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.1 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.23 
 
 		 542 aa  183  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.27 
 
 		 545 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 544 aa  183  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 512 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  29.28 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.27 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.55 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.37 
 
 		 518 aa  178  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 515 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.91 
 
 		 524 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 510 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.8 
 
 		 542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 529 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 559 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.76 
 
 		 531 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 522 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.27 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 607 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>