167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3212 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3212  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  56.55 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  52.12 
 
 		 183 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1430  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.1 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.166298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1144  chemotaxis protein CheD, putative  47.41 
 
 		 131 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000787559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.53 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0877  hypothetical protein  37.27 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  44.23 
 
 		 160 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  32.1 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.64 
 
 		 194 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  34.29 
 
 		 157 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1147  chemotaxis protein  35.15 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.332567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.66 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.85 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.19 
 
 		 175 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.39 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  31.87 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.87 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.29 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  31.65 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  28.57 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.52 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.05 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  27.84 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  31.03 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.14 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  31.03 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.03 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1042  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.54 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.66 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.21 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.07 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.22 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  26.99 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.54 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  30.72 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.57 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  28.86 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.41 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.34 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3810  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.48 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.93 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0123  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  32.48 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.05 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.48 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3219  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.34 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0914771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.54 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2970  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.41 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077588 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  28.49 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.8 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  30.67 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  29.45 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2161  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.74 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.847826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.57 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.81 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.17 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.33 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00056  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.38 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00180609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  30.56 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2855  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1688  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.332002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3851  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3120  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.82 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806479  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0153  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.48 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0570  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.21 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  28.89 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0186  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.23 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.89 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.38 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0905  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.48 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.89 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.23 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.89 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.38 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  26.11 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3150  hypothetical protein  28.66 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.54 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2102  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.98 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.28508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2243  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.98 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.030336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  28.32 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2360  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  27.98 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  30.83 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  26.32 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  29.05 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  29.94 
 
 		 171 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  31.69 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1844  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.07 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.94 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  27.45 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  32.56 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  27.86 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  28.48 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  27.59 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02190  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.727435  normal  0.427786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  28.75 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>