More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1984 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1984  ATPase  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  69.17 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  68.98 
 
 		 261 aa  354  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  67.48 
 
 		 264 aa  351  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  61.66 
 
 		 298 aa  307  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  55.97 
 
 		 264 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  53.04 
 
 		 254 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  51.63 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  52.48 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  51.2 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  54.94 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  53.14 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  48.39 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  52.44 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  49.79 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  48.96 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  47.95 
 
 		 293 aa  221  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  49.04 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  45.2 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  46.22 
 
 		 273 aa  204  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  46.77 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  40.26 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  43.33 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  41.8 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  40.17 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  43.81 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.84 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  48.26 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  42.26 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  38.55 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  43.39 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.6 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  48.51 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  45.28 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  45.45 
 
 		 295 aa  185  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  46.04 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  41.84 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  42.11 
 
 		 273 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  45.26 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  43.44 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  43.44 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  43.44 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  45.85 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  43.03 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  41.18 
 
 		 359 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  43.36 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.87 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.92 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.92 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  42.21 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  46.05 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  42.21 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  45.91 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  42.42 
 
 		 292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  39.43 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.97 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 397 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.32 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  39.24 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.52 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.5 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.5 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  39.24 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  38.66 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  39.08 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  41.56 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  40.34 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  41.13 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  41.15 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  37.56 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  39.57 
 
 		 282 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  37.65 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.66 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  48.33 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  36.29 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  38.66 
 
 		 378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  40.26 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  40.87 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>