61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3770 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  78.74 
 
 
254 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  57.76 
 
 
266 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  53.36 
 
 
266 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.02 
 
 
203 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  36.59 
 
 
222 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.96 
 
 
132 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.48 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  35.11 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.52 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  36.78 
 
 
166 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  39.08 
 
 
334 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  36.46 
 
 
123 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  31.58 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.78 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  33.02 
 
 
341 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  34.19 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  33.04 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  31.86 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  31.43 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  30.25 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  37.5 
 
 
306 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  34.19 
 
 
109 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  34.19 
 
 
109 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  34.19 
 
 
109 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  34.19 
 
 
109 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  34.19 
 
 
109 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  29.41 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  32.69 
 
 
119 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  35.29 
 
 
307 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  27.59 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  30.19 
 
 
497 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  29.75 
 
 
877 aa  48.9  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  27.2 
 
 
207 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  32.58 
 
 
257 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  35.48 
 
 
570 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  29.09 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  32.77 
 
 
117 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  36.47 
 
 
296 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  25.62 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  35.23 
 
 
479 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  25.21 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  27.27 
 
 
463 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  30.12 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  39 
 
 
462 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  29.89 
 
 
100 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  28.07 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  31.33 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  34.12 
 
 
434 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  31.25 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  32.91 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  32.14 
 
 
132 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  32.91 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  34.58 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  33.77 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>