46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3692 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  70.97 
 
 		 465 aa  671    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  959    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  41.14 
 
 		 464 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  37.94 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  33.61 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  34.57 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  31.88 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  26.49 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  26.58 
 
 		 565 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  26.23 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  26.32 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  27.35 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  24.58 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  32.03 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  28.12 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  31.08 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  32.27 
 
 		 617 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  28.91 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  28.02 
 
 		 369 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  26.54 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  26.46 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  25.31 
 
 		 377 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.22 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  31.43 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  30.74 
 
 		 595 aa  80.5  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  28.57 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  33.08 
 
 		 224 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  23.83 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  29.63 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  32.35 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  32.81 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  26.15 
 
 		 368 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  25.81 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  25.65 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.81 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  26.02 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  20.26 
 
 		 584 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  22.81 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 583 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  22.52 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  29.17 
 
 		 580 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  31.87 
 
 		 255 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  44.9 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  29.01 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>