More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3312 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  54.66 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  54.66 
 
 		 280 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  43.37 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1310  extracellular solute-binding protein  49.17 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0439  extracellular solute-binding protein  38.11 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.501254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.6 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  29.11 
 
 		 317 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 246 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  29.62 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  27 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0301  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.31 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4696  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 296 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.871044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  27.5 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2743  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0284405  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  27.97 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.43 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  26.99 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.99 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  26.99 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0401  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.99 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  27.43 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.46 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.55 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.17 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.17 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.17 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.17 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0246  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  29.87 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0240  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  30 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.87 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 257 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 302 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.87 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 311 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  25.54 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  26.09 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  27.78 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.62 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2858  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.68 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  27.24 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.35 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  25.54 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  28.39 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1982  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  26.17 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>