290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3263 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  768    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  70.02 
 
 		 549 aa  766    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  766    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  768    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  768    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  71.3 
 
 		 549 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  71.3 
 
 		 549 aa  770    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  76.23 
 
 		 548 aa  851    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  70.2 
 
 		 549 aa  768    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  768    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  64.12 
 
 		 552 aa  678    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  76.05 
 
 		 548 aa  851    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  70.02 
 
 		 563 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  72.94 
 
 		 549 aa  798    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  85.4 
 
 		 548 aa  935    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  71.3 
 
 		 549 aa  770    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 548 aa  1094    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  70.02 
 
 		 563 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  70.02 
 
 		 548 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  70.2 
 
 		 549 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  70.02 
 
 		 563 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  69.6 
 
 		 548 aa  767    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  70.02 
 
 		 563 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  47.64 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  47.83 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  47.56 
 
 		 555 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  48.73 
 
 		 554 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  48.1 
 
 		 555 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  47.92 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  47.92 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  47.38 
 
 		 555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  47.56 
 
 		 555 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  47.74 
 
 		 631 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  46.85 
 
 		 654 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  47.03 
 
 		 585 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  47.03 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  47.03 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  44.78 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  40.96 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  40.96 
 
 		 566 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  43.73 
 
 		 548 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  44.21 
 
 		 581 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  44.02 
 
 		 553 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.43 
 
 		 577 aa  359  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  42.14 
 
 		 545 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  44.68 
 
 		 548 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  44.14 
 
 		 543 aa  350  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  44.5 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  39.85 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  44.5 
 
 		 548 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  40.87 
 
 		 542 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  40.18 
 
 		 547 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  40.6 
 
 		 545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  39.89 
 
 		 546 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  46.39 
 
 		 545 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  37.97 
 
 		 546 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  38.85 
 
 		 560 aa  293  8e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  31.68 
 
 		 666 aa  231  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.82 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 680 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 		 680 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  32.68 
 
 		 679 aa  216  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 537 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 667 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.15 
 
 		 690 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  31.09 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29 
 
 		 698 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  29.37 
 
 		 537 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 		 534 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  34.54 
 
 		 770 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 705 aa  194  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 757 aa  193  8e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  30.12 
 
 		 535 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.86 
 
 		 532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 536 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.13 
 
 		 688 aa  187  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 666 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 		 524 aa  183  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  28.55 
 
 		 680 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  32.49 
 
 		 689 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  32.06 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.23 
 
 		 527 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  29.4 
 
 		 550 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 653 aa  177  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  27.29 
 
 		 524 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  28.6 
 
 		 535 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.85 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  29.4 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  27.37 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 624 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>