More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0614 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  62.77 
 
 		 231 aa  310  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0403  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.3 
 
 		 231 aa  302  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 231 aa  297  7e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1158  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.3 
 
 		 231 aa  295  5e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1033  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.3 
 
 		 232 aa  295  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0774  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.43 
 
 		 232 aa  291  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.937029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  58.37 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  57.08 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  56.22 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  55.98 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.79 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.79 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  53.65 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  56.84 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  56.22 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  54.08 
 
 		 235 aa  252  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  55.79 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 233 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.7 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  53.85 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  53.85 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.07 
 
 		 238 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  54.7 
 
 		 239 aa  248  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  53.88 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  52.36 
 
 		 238 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  52.36 
 
 		 238 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  53.22 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  55.32 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  55.36 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.08 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  54.94 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  54.94 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.08 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.08 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.08 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  54.85 
 
 		 234 aa  244  6e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.08 
 
 		 233 aa  244  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.51 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  51.93 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  55.04 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  51.71 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.5 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.93 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  55.23 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.36 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  56.54 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.94 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  53.45 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.27 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  53.45 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  52.56 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  54.04 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  54.51 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 237 aa  241  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.94 
 
 		 247 aa  241  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.22 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  54.08 
 
 		 238 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  52.52 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  55.56 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.42 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  51.26 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  52.36 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  52.99 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>