More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3010 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
462 aa  925    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  72.63 
 
 
461 aa  664    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  67.25 
 
 
470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  64.33 
 
 
487 aa  591  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  62.5 
 
 
461 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  57.36 
 
 
455 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  57.14 
 
 
455 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  57.14 
 
 
455 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.92 
 
 
455 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  56.92 
 
 
455 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  59.65 
 
 
471 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  55.92 
 
 
453 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  59.65 
 
 
471 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  59.2 
 
 
471 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.7 
 
 
451 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.49 
 
 
451 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.92 
 
 
451 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  54.27 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  54.27 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  54.27 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.7 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.49 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  54.27 
 
 
451 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.72 
 
 
468 aa  356  5.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.11 
 
 
465 aa  355  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004028  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.46 
 
 
475 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.49 
 
 
483 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.07 
 
 
476 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.53 
 
 
459 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.33 
 
 
491 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.65 
 
 
487 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.21 
 
 
475 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.94 
 
 
491 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.6 
 
 
475 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.57 
 
 
478 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.75 
 
 
470 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.68 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  34.76 
 
 
464 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.77 
 
 
478 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0279  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.62 
 
 
515 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.384875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0206  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
504 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00226035  decreased coverage  0.00000242009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.69 
 
 
504 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.05 
 
 
465 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3463  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.74 
 
 
477 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.35 
 
 
495 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.94 
 
 
477 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.7 
 
 
485 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3602  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.25 
 
 
504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139548  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.41 
 
 
484 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.64 
 
 
489 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.73 
 
 
480 aa  209  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.28 
 
 
482 aa  204  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.37 
 
 
482 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.87 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.3 
 
 
486 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.57 
 
 
482 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.57 
 
 
482 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.37 
 
 
482 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.37 
 
 
481 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.93 
 
 
482 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.03 
 
 
492 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.78 
 
 
481 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.16 
 
 
482 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.31 
 
 
482 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.57 
 
 
528 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.37 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.04 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.34 
 
 
481 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.04 
 
 
473 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.32 
 
 
500 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.55 
 
 
513 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.42 
 
 
510 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 
490 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.09 
 
 
481 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 
520 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 
522 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  29.11 
 
 
515 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 
518 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.15 
 
 
491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.25 
 
 
513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.73 
 
 
494 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
508 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.15 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.36 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.02 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.02 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
546 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.68 
 
 
483 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
546 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  29.03 
 
 
546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 
477 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
527 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>