175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3446 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  56.28 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.63 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  51.72 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  45.69 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  44.9 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  44.9 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  44.9 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  45.88 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  44.85 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  44.28 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  49.51 
 
 		 204 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  44.85 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  44.9 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  44.85 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2773  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.28 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  44.28 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  45.41 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  44.85 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  50 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  47.76 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0413  CmeB  43.3 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  47.45 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  44.67 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  46.31 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  51.05 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  48.24 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  45.27 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  50.76 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  45.27 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.94 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  46.04 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  50.77 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.29 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  44.39 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.34 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.28 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  45.13 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  45.77 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  41.18 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  41.18 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  41.18 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  41.18 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  51.27 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  41.18 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  48.97 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  43.78 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  45.92 
 
 		 196 aa  151  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  44.16 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  44.16 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4370  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.44 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  41.18 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4336  lysine exporter protein LysE/YggA  46.83 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4248  hypothetical protein  49.24 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  40.69 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  43.15 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.43 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.77 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  46.35 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.67 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  43.3 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  42.64 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1703  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.8 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0159  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.61 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3100  LysE family transporter  49.73 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0629336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  44.1 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.67 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  47.09 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  45.23 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  43.09 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  41.5 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  42.93 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  42.93 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  42.93 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  42.93 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  42.93 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  42.93 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  42.93 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  40.7 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.12 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3694  lysine exporter protein LysE/YggA  48.48 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.095431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  44.22 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  46.35 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  42.55 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  44.72 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26510  Lysine exporter protein  46.32 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>