More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3219 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  57.51 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  57.14 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  56 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  53.82 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  50.55 
 
 		 280 aa  265  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  41.96 
 
 		 606 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.55 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.23 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 		 457 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  38.04 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  42.35 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.75 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  41.63 
 
 		 461 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.75 
 
 		 258 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  37.07 
 
 		 462 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 		 458 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  39.45 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.49 
 
 		 458 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  37.3 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.73 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.75 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  40.08 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  37.3 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  40.93 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.44 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  33.98 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.8 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  35.63 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  38.67 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  38.1 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.65 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  36.51 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  39.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.97 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  36.51 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  39.06 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  39.06 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.38 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.84 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  37.7 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5258  hydrolase, TatD family  40.4 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  32.54 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  31.78 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  40.17 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.98 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  37.07 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  34.52 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  35.55 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  34.77 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  33.98 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  32.68 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  33.99 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  33.99 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  35.79 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  37.8 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 261 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  38.52 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  36.68 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  35.69 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.2 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>