More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0998 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0998  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  523  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  53.17 
 
 
251 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  51.19 
 
 
251 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  51.81 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  49.01 
 
 
259 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  52.21 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  52.21 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  51.41 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49.2 
 
 
271 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  47.04 
 
 
255 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  47.06 
 
 
261 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
255 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  46.64 
 
 
255 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 
250 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  49.21 
 
 
265 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  47.74 
 
 
255 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  46.09 
 
 
255 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  45.49 
 
 
277 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  49.8 
 
 
261 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  47.06 
 
 
275 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  47.06 
 
 
275 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  47.06 
 
 
275 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  47.24 
 
 
261 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  45.2 
 
 
289 aa  228  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  46.4 
 
 
294 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  45.85 
 
 
273 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  46.27 
 
 
283 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  45.45 
 
 
255 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  48.85 
 
 
271 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  46.37 
 
 
258 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
256 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  46.37 
 
 
258 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  46.37 
 
 
258 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  46.09 
 
 
255 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  46.37 
 
 
258 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  47.47 
 
 
258 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46.27 
 
 
293 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  46.18 
 
 
270 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  46.46 
 
 
265 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  46.59 
 
 
259 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  46.46 
 
 
265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  46.03 
 
 
258 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.97 
 
 
258 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  43.31 
 
 
262 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.38 
 
 
265 aa  224  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
255 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
259 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  45.97 
 
 
258 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  49.6 
 
 
257 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.92 
 
 
270 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  49.4 
 
 
261 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  44.66 
 
 
256 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  45.63 
 
 
260 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.6 
 
 
263 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  47.01 
 
 
274 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
258 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 
261 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  45.02 
 
 
259 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
256 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  45.02 
 
 
257 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  45.45 
 
 
266 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  46.8 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  44.71 
 
 
256 aa  222  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 
255 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.98 
 
 
256 aa  221  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  49.41 
 
 
276 aa  221  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
255 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  45.02 
 
 
260 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  48.35 
 
 
252 aa  221  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  45.02 
 
 
260 aa  221  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  48.19 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.98 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
255 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  44.62 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  49 
 
 
261 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  45.1 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.38 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  44.84 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  46.43 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  47.43 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.83 
 
 
257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.58 
 
 
256 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  45.53 
 
 
277 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.98 
 
 
264 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  45.85 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 
254 aa  219  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  45.14 
 
 
262 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  45.27 
 
 
255 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.56 
 
 
333 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  48.19 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  44.09 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
256 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>