More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2158 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2158  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
589 aa  1150    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.812368  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3626  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  53.14 
 
 
586 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0753  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  54.4 
 
 
592 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  50 
 
 
588 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1632  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.18 
 
 
565 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2290  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.56 
 
 
569 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.85 
 
 
594 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3956  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.6 
 
 
566 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3669  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.8 
 
 
566 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.94 
 
 
566 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0353953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.07 
 
 
575 aa  357  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330722  normal  0.0780403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2964  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.65 
 
 
564 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589522 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0846  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.72 
 
 
595 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2865  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.16 
 
 
588 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.643493  normal  0.225438 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5151  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.78 
 
 
618 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0571898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3445  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.69 
 
 
612 aa  222  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  35.56 
 
 
1245 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.01 
 
 
605 aa  159  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 
500 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0552  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.7 
 
 
531 aa  157  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.667644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  34.64 
 
 
683 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  31.62 
 
 
1264 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.14 
 
 
529 aa  152  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  33.08 
 
 
1253 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  27.82 
 
 
604 aa  146  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
1265 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  30.02 
 
 
673 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.8 
 
 
525 aa  144  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  30.52 
 
 
671 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.01 
 
 
499 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.47 
 
 
969 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  31.28 
 
 
577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  33.76 
 
 
470 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.6 
 
 
522 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.25 
 
 
971 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.07 
 
 
967 aa  140  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4834  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
585 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.01 
 
 
943 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1781  hydrogenase subunit F  29.2 
 
 
482 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.81 
 
 
672 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1217  NADH dehydrogenase subunit M  29.17 
 
 
614 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1042  hydrogenase subunit F  29.72 
 
 
482 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0875  hydrogenase subunit F  29.72 
 
 
482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.53 
 
 
972 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.9 
 
 
624 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.92 
 
 
997 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  32.04 
 
 
644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  35.22 
 
 
687 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.73 
 
 
788 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 
473 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  32.84 
 
 
654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  34.63 
 
 
792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.28 
 
 
970 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.9 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  33.43 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.69 
 
 
654 aa  135  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0937  hydrogenase subunit F  29.43 
 
 
482 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.92 
 
 
952 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.77 
 
 
472 aa  135  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  28.3 
 
 
480 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.32 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.28 
 
 
674 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.34 
 
 
535 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.33 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.25 
 
 
959 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.34 
 
 
535 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.34 
 
 
535 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.06 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  30.97 
 
 
669 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  29.14 
 
 
500 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.06 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  30.31 
 
 
476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.54 
 
 
654 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  34.82 
 
 
654 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.74 
 
 
642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.94 
 
 
507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.59 
 
 
628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  35.03 
 
 
672 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.43 
 
 
639 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.43 
 
 
639 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.43 
 
 
639 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  29.53 
 
 
672 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.54 
 
 
1024 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  29.7 
 
 
672 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1599  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.21 
 
 
762 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  29.74 
 
 
672 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  31.79 
 
 
525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  29.53 
 
 
672 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  29.53 
 
 
672 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  31.58 
 
 
673 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  29.47 
 
 
672 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  31.3 
 
 
617 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  29.53 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.28 
 
 
649 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.52 
 
 
759 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31 
 
 
979 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  32.85 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.04 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  31.29 
 
 
679 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.77 
 
 
953 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>